연자방아가 놓여 있는 유물관을 들어서면 국보 제 240호인 공재 윤두서의 자화상을 비롯 보물로 지정된 어부사시사, 오우가 등이 담긴 고산의 수적관계 문서와 지정 14년 고려조 공민왕 3년(1354년) 노비문권 등 고산윤선도와 해남윤씨 들이 남긴 유물 4천6백여점이 보관되어 있다.

보물 제481호로 지정된 해남윤씨 가전고화첩은 지본수묵(紙本水墨)혹은 담채(淡彩)한 소품들을 체계 없이 조성한 것으로 크기나 소재, 기법이 다양하여 공재회화의 정수를 보여준다.

또한 보물 제 482호인 윤고산 수적관계문서는 고산의 수적(手蹟)과 고산에 관계되는 문헌을 일괄해서 지정한 것이다. 여기에는 금쇄동집고, 금쇄동기, 산중신곡이 있고 고산의 관계문서로는 은사첩, 윤고산양자예조입안문서가 있다.

보물 제483호로 지정된 노비문권은 고려시대의 노비문서로 소지(所志) 6장, 입안(立案) 2장, 모두 8장으로 된 문서로 오랜 년대를 내려오는 동안 좀이 먹어 훼손된 것을 1755년(영조20)에 다시 6장을 한 제첩으로 다시 꾸며 전가고적(傳家古跡)이라고 표제를 붙여서 간수하고 있다.

이것은 고려 공민왕 때의 직장동정(直長同正)인 윤광전이 그의 적장자로 소윤(少尹)이 관직을 가진 윤단학(尹丹鶴)에게 노비를 상속해주는 증서다. 문자의 내용은 이두문으로 되어있고 고대의 이문서는 송광사의 노비첩과 함께 현재 알려진 고려시대의 유일한 문서다.

이외에도 해남윤씨들이 남긴 많은 유물들이 전시되어 있어 그때의 영화를 느끼게 해준다.